Song song với việc tìm kiếm khách hàng và mở rộng thị trường cho ngành đóng tàu, Công ty Sông Thu cũng giữ được mối quan hệ kinh doanh tốt với các khách hàng truyền thống trong lĩnh vực ngành thương mại, dịch vụ cảng, sửa chữa tàu và làm sạch tàu dầu siêu trọng.

Trong thời gian gần đây, những tai nạn của những tàu chở dầu hết sức nghiêm trọng, nhưng việc vệ sinh, làm sạch cặn dầu của những chiếc tàu chở dầu có trọng tải lớn luôn được Công ty hoàn thành tốt. Với những máy móc và công nghệ hiện đại của mình, Công ty đã phục vụ cho công tác vệ sinh và ứng cứu các sự cố tràn dầu, góp phần giảm thiểu được sự ô nhiễm môi trường  do xăng dầu gây ra.

Hàng năm, Công ty luôn nhận được các đơn hàng từ các chủ tàu vận tải, trung tâm cứu hộ cứu nạn, Quân chủng Hải quân, Hyundai Vinashin Shipyards, Vietsovpetro, các chủ tàu dầu Hy Lạp, Singapore, Nhật Bản, v.v... Dịch vụ làm sạch tàu dầu của Công ty được đánh giá là đạt tiêu chuẩn châu Âu, đáp ứng được đòi hỏi cao về tiêu chí bảo vệ môi trường và cũng được khách hàng đánh giá cao.

Có thể kể đến những dự án làm sạch tàu dầu tiêu biểu mà Công ty đã tham gia thực hiện như:

- Các tàu Aptera M (2000), tàu Bunga Kelanasatu (2002), tàu Olympic Spirit (2002), tàu Seacross II (2003), tàu Lombo Este (2004), tàu Timor Sea (2004), tàu Apollo (2005), tàu Onozo (2005), tàu  Sprit II (2007) của Công ty TNHH nhà máy tàu biển Hyundai Vinashin;

- Các tàu Ba Vì (2005, 2007), tàu Chi Lăng (2005), tàu Vietsovpetro-01 (2006), tàu Chí Linh (2007, 2009) của Xí nghiệp liên doanh Vietsovpetro;

- Tàu Rạng Đông 01 (2008) của Công ty TNHH MTV đóng tàu và thương mại Petrolimex.

Hiện tại công ty đang triển khai dự án “Vệ sinh và xử lý cặn dầu thô để sửa chữa duy trì cấp tàu chứa dầu Vietsovpetro-01” của XNLD Vietsovpetro sau khi trúng thầu gói thầu này vào tháng 07 năm 2011.